La filosofía de la I.E. Francisco de Paula Santander se fundamenta en el desarrollo humano y social de la persona, a través del cual se basa la formación en sus dimensiones básicas: Espiritual, emocional, cognitiva, investigativa y social.

La dimensión espiritual reconoce en la persona como el ser que busca trascender en busca de la relación con Dios, en la cual fundamenta la fe y su compromiso misional.

La dimensión emocional se asocia con la canalización de las emociones para fundar y fortalecer positivamente la convivencia con las demás personas.

La dimensión cognitiva se fundamenta en el desarrollo de la inteligencia comprensiva y propositiva, en la cual fundamenta la forma de pensar y de aprender en el contexto.

La dimensión investigativa forma a la persona en las capacidades y habilidades para resolver problemas mediante el uso de las habilidades cognitivas.

La dimensión social fortalece los vínculos con el contexto y la formación ciudadana.

La filosofía de la institución se resume en la frase: “FORMAMOS PERSONAS PARA EL DESARROLLO HUMANO Y SOCIAL”.